XLEAP-SBS-kemi Snabbreferens

Det här avsnittet ger en översikt av hur användningen av XLEAP-SBS-kemin påverkar hur användare interagerar med sekvenseringssystemet NextSeq 1000/2000. Det finns kompatibilitetskrav och procedurändringar som måste följas för att använda XLEAP-SBS-kemi. Dessa kompatibilitetskrav och procedurändringar beskrivs här. Mer information finns i XLEAP-SBS sekvenseringsprotokoll.

Följande programuppdateringar kan installeras av kunden. Installationsanvisningar för både online- och offlineinstallationer finns i NextSeq 1000/2000 Control Software v1.7 Customer Release Notes på Illuminas supportwebbplats.

Kompatibilitetskrav

Programvara

•

Kontrollprogrammet NextSeq 1000/2000 v1.7 eller senare. Installationsinstruktioner för programvara och installation finns på sidan Nedladdningar av programvara på Illuminas supportsida.

•

DRAGEN v4.2 eller senare. Installationsinstruktioner för programvara och installation finns på sidan Nedladdningar av programvara på Illuminas supportsida.

Referensgenom

•

DRAGEN v4.2 v9 referensgenom. Ladda ned från produktfilsidan på Illuminas supportsida.

Förändringar i proceduren

•

Laddningskoncentrationer och cykelantal har ändrats. Se Att tänka på vid XLEAP-SBS-sekvensering.

•

De upptiningstider som krävs för XLEAP-SBS-förbrukningsmaterial är olika. Se Tina XLEAP-SBS-förbrukningsmaterial.

•

Procedurer för denaturering och utspädning på instrumentet har ändrats. Se Generatorn för denaturerings- och utspädningsprotokoll.

•

Kassettförberedelse inkluderar nu ett steg för att minska luftbubblor och stabilisera kassettkomponenter, och vändning görs långsamt. Se Förbereda kassetten.

•

Q-tabellsammanställning (”binning”) uppdateras för att återspegla den förbättrade sekvenseringskvaliteten och noggrannheten hos XLEAP-SBS-kemi. Se Arbetsflöde för Real-Time Analysis.

•

Ny anpassad primer för XLEAP-SBS. Se Anpassade primrar.

•

Nya recept för sekvensering utan avbildning för XLEAP-SBS. Se Sekvensering utan avbildning.